Το Πατριαρχικό Ίδρυμα Πατερικών Μελετών έχει στην κατοχή του δύο αρχεία μοναδικά ανά τον κόσμο, ευγενική παραχώρηση – ευλογία των Ιερών Μονών του Αγίου Όρους στο Ίδρυμα:
- Το αρχείο μικροταινιών (microfilms) από περίπου 9.100 χειρόγραφα των βιβλιοθηκών των Ιερών μονών του Αγίου Όρους, και
- Το αρχείο περίπου 4.000 διαφανειών (slides) από μικρογραφίες των εικονογραφημένων χειρογράφων των Ιερών μονών του Αγίου Όρους.
Το πρώτο αρχείο περιλαμβάνει σήμερα εννέα χιλιάδες εκατό (9.100) περίπου μικροταινίες (films) από δεκαεννέα (19) μονές καί τρεις ( 3 ) σκήτες του Αγίου Όρους. Για να διαφανεί το μέγεθος αυτού του αρχείου αρκεί να σημειωθεί ότι υπερτερεί αριθμητικά του συνόλου των αντίστοιχων αρχείων μικροταινίων και ψηφιοποιημενων συλλογών ελληνικών χειρογράφων σε όλες τις άλλες ευρωπαϊκές χώρες.
Ειδικότερα, η κατανομή των μικροφωτογραφημένων χειρογράφων κατά Μονές και Σκήτες είναι κατά αλφαβητική σειρά η ακόλουθη: